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帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 14:40
biokook
本人生物专业,最近开始使用linux,麻烦哪位同仁推荐一款linux下比较好用的序列分析软件。请不要推荐wine,一直不喜欢那玩意。谢谢

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 14:55
月下叹逍遥
FinchTV?
网上找的,先声明:我不是学生物的 :em06

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 15:12
biokook
pocoyo 写了:真专业 还有这玩意儿
很多生物信息的相关软件都是在linux或者unix下运行的阿!

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 15:23
biokook
月下叹逍遥 写了:FinchTV?
网上找的,先声明:我不是学生物的 :em06
没有搞定呢,不过还是谢谢您。

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 19:38
yixf
EMBOSS系列!

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-27 19:59
qifei9
DNA序列分析……你这范围太大了点吧……

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-28 5:17
biokook
qifei9 写了:DNA序列分析……你这范围太大了点吧……
我现在主要想实现的功能有:
序列比对、引物设计以及序列拼接,基本上满足这些要求就可以了,高手有推荐的吗?

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-31 13:45
qifei9
引物设计可以用primer3,
序列比对,拼接?你是指align、assembly?大规模的可以用bowtie、cufflinks这种。

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-05-31 14:12
nmsfan
banban呢???

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-06-02 19:04
biokook
nmsfan 写了:banban呢???
banban是啥?

Re: 帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

发表于 : 2011-07-14 14:55
billzt
(1)新立得里有 ugene
(2)Mega 5 有 Linux 版本,当然本质上是 wine 的
(3)bioedit 的 wine 效果很不错,只是退出时会有报错