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用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-07 10:02
syfnet
在我的一个文本文件(log.txt)的格式如下:

代码: 全选

NCI_100058_a		-4.8
NCI_100058_b		-5.0
NCI_100120		-4.7
NCI_10042		-4.6
NCI_100827		-4.9
NCI_10091		-4.2
NCI_100942		-3.9
NCI_101266		-3.8
NCI_101679		-4.5
NCI_10173_a		-4.3
NCI_10173_b		-4.4
NCI_101789		-6.8
NCI_101809		-4.3
...........
其中以NCI起始的为某一目录下存在的一个文件,我想用一段脚本将这些文件提取到一个名为selected的目录中,请问该如何实现?

Re: 用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-07 12:57
t3swing

代码: 全选

#!/bin/bash

for file in $(cat log.txt|grep -o "NCI_[^ ]*")    #log.txt  注意路径
do
	path=
	path=$(find . -name $file)   #find修改一下,此处搜索当前路径
	if [ -n "$path" ]; then
		cp $path /home/../selected#selected的绝对路径补充完整
		echo "${file}路径为${path}"
	else
		echo  "${file}未找到!"
	fi
done

exit 0
不知道理解错意思没,注释的地方要改下,高效的方法期待高人给出!

Re: 用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-07 15:38
syfnet
非常感谢您。find文件的时候,能不能设定在某一目录下包括子目录呢?

Re: 用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-07 16:07
t3swing
find搜索默认是包含子目录的(不包含某一子目录用-prune等参数),如果没有设搜索深度(man一下吧,find参数太多,一般用的时候再查)的话,都是包含搜索子目录的
find 的第一参数一般是搜索目录, . 为当前目录,把 . 换成你要搜索的目录就可以了 ,建议你查下find的用法

find是非常强大的命令,可以完成windows下面很多不能完成的搜索任务,但同时也是一个很难用熟的一个命令,记得基本的参数就可以了 .

Re: 用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-07 17:21
syfnet
:em11 非常感谢

Re: 用脚本批量提取指定的文件

发表于 : 2009-10-11 22:35
syfnet
今天将该教本用于大规模工作,发现在搜索3万个文件的时候,find不能搜到制定文件。即使是我先ls,然后find其中一个文件,还是不能搜到,何故?