帮忙推荐一款在ubuntu下使用的DNA序列分析软件

[biokook]

本人生物专业，最近开始使用linux，麻烦哪位同仁推荐一款linux下比较好用的序列分析软件。请不要推荐wine，一直不喜欢那玩意。谢谢

[月下叹逍遥]

FinchTV?
网上找的，先声明：我不是学生物的

[biokook]

真专业 还有这玩意儿

很多生物信息的相关软件都是在linux或者unix下运行的阿！

[biokook]

FinchTV?
网上找的，先声明：我不是学生物的

没有搞定呢，不过还是谢谢您。

[yixf]

EMBOSS系列！

[qifei9]

DNA序列分析……你这范围太大了点吧……

[biokook]

DNA序列分析……你这范围太大了点吧……

我现在主要想实现的功能有：
序列比对、引物设计以及序列拼接，基本上满足这些要求就可以了，高手有推荐的吗？

[qifei9]

引物设计可以用primer3，
序列比对，拼接？你是指align、assembly？大规模的可以用bowtie、cufflinks这种。

[nmsfan]

banban呢？？？

[biokook]

banban呢？？？

banban是啥？

[billzt]

（1）新立得里有 ugene
（2）Mega 5 有 Linux 版本，当然本质上是 wine 的
（3）bioedit 的 wine 效果很不错，只是退出时会有报错