请问shell中简单的pbs怎么书写？

[King1991]

已经写好了程序运行的shell脚本，但是现在需要放在学校服务器上，怎么添加pbs呢？是在shell脚本的开始设置#pbs ...之类的吗？只需要简单的指令，能把任务发送到服务器就可以

[astolia]

pbs？Pokemon Battle Simulator？

http://latisresearch.umn.edu/creating-a-PBS-script
https://www.msi.umn.edu/content/job-sub ... bs-scripts

[King1991]

对，就是这个作业管理系统。我之前在自己的linux上已经写好了可执行的文件，然后用shell脚本运行也没有错误。现在需要放在学校的服务器上。然后我写的pbs是这样的
#!/bin/bash
#PBS -N wang_test
#PBS -l nodes=31:ppn=1
#PBS -o /home/wang/kuramoto_finite/rand/rand.out
#PBS -e /home/wang/kuramoto_finite/rand/rand.err
#PBS -r y
cd /export/panfs02/home/wang/kuramoto_finite/rand
nohup ./run.sh &

请问这样是不是就可以了，我按照这个提交后，任务正在排队。


还有一个问题就是#PBS -l nodes=31:ppn=1的分配有什么讲究吗？我申请的配置是40cpu 10核/cpu。

[astolia]

服务器上的路径不是/home/wang/kuramoto_finite/rand/rand.*这个吧。nodes和ppn这个要看你任务的并发执行需求

[King1991]

服务器上的路径没有问题就是这个。我不太明白这个节点数和核数的需求是怎么选择的。比如我的shell一次并行30个单核计算，是不是就是nodes=30:ppn=1？

[astolia]

你需要考虑对方总共提供了多少个node，每个node有多少cpu核心，node的总体利用率如何。
比如你写nodes=30，就要求至少要有30个node都不能被占满，否则只能等别人的任务算完，把node空出来才轮到你
ppn小于node的核心数，意味着你要和别人共享一个node，也就是可能会被别人的任务拖慢。
如果不同node间的硬件配置不同，不同的ppn值可能会影响到分配node时的偏好，导致一些执行效率上的差异。

如果你不想管那么多，那就不用nodes和ppn，用procs。让系统自动给你分配足够的核心数，不管在多少个node上